Prima dell’attuale edificio rinascimentale, sorgevano in questo luogo tre chiese, edificate a partire dal IV secolo e dedicate a Cristo Salvatore, a san Giovanni Battista e alla Vergine Maria. Lo spazio liturgico dedicato al Battista, che inizialmente fungeva da battistero, venne ingrandito in epoca longobarda e, col passare del tempo, fu preferito al Salvatore, ospitando la cattedra episcopale. Il Museo Diocesano, visitabile nei sotterranei del Duomo, custodisce i resti archeologici di questi antichi edifici.